制药与材料学院实验室成立于1996年5月（待确定），主要下设有基础化学实验室、专业实验室、精馏实验厂房和科研实验室等24间，面积约3000m2，仪器设备500余台套，总价值700多万元。近年来，学校重点加强实验建设与教学，新建了无机化学、有机化学、药物化学、药理学等实验室及相关设施，学生实验基本实现双人组，人均有效使用面积3m2。现有高效液相色谱仪（HPLC）、红外光谱仪（IR）、气相色谱仪（GC）、原子吸收分光光度计、紫外分光光度计等先进的大型仪器满足学生、教师的教学和科研需求。
实验室依托药学、药品经营与管理、药物制剂技术、应用化工技术、宝玉石鉴定与加工专业、1+X药品购销考评站点与绿色环保新材料淮南市技术创新中心进行建设，目前开设有无机化学、有机化学、分析化学、药物化学、药物分析、中药材识别、制药设备使用与维护、化工主控操作、宝玉石加工工艺等二十几门实验课程。
实验室坚持以技能培养为特色，立足安徽、辐射长三角，培养适应于地方基技能型人才为任务；以学生为本，注重知识传授、能力培养与素质提高协调发展的教育理念和以技能培养为核心的实验教学观念。同时鼓励教师积极开展实验教学改革和实验教学研究，让实验教学更贴近实际，提高学生的实验技能。
制药与材料学院实验室下设：
分析化学实验室
药物制剂实训室
药物分析实验室
药品营销实训室
天平室
液相色谱实训室
气相色谱实训室
精馏实训厂房
绿色环保新材料淮南市技术创新中心